Read the dengue dataset of [SINAVE](https://www.sinave.gob.mx/)

read_dengue_dataset(
  path,
  spatial_resolution,
  status_caso,
  des_edo_res = NULL,
  des_mpo_res = NULL
)

Arguments

path

is the path of dengue dataset.

spatial_resolution

is the spatial resolution or the administrative level. The values are country, state and municipality.

des_edo_res

is a string for define the state in uppercase.

des_mpo_res

is a string for define the municipality in uppercase.

estatus_caso

1 probable, 2 confirmado, & 3 descartado.

Value

a data.table object.

Author

Felipe Antonio Dzul Manzanilla felipe.dzul.m@gmail.com

Examples

read_dengue_dataset(path = "/Users/felipedzul/Dropbox/dataset/dge/denv/2025/DENGUE2_.txt", spatial_resolution = "state", des_edo_res = "NUEVO LEON", status_caso = c(1, 2))
#>               FOL_ID  VEC_ID IDE_EDA_ANO IDE_SEX DES_CAL        IDE_CAL NUM_EXT
#>               <char>   <int>       <int>   <int>  <char>         <char>  <char>
#>   1: 190260000000000 1962337           1       1   CALLE      EUCALIPTO     204
#>   2: 190260000000000 1962349          12       2   CALLE          PIRUL     302
#>   3: 19039CAMJ130418 1962432          11       1 AVENIDA    ARTICULO 27     813
#>   4:   223DOFM031004 1913787          21       2   CALLE          TITAN     204
#>   5: 30086LOMA911028 1913997          33       1   CALLE      BOCANEGRA     821
#>  ---                                                                           
#> 195: 19046LOBF090910 1972319          15       2   CALLE           ABAD     836
#> 196: 19038MARP851216 1972340          39       2   CALLE       CONOCIDO      SN
#> 197: 19038SACG680602 1972347          57       1   CALLE       GUERRERO    1103
#> 198: 19039AAFD191021 1972364           5       1   CALLE       ORQUIDEA    1045
#> 199: 19044FOGA811018 1972434          43       2   CALLE BERNARDO REYES     260
#>      NUM_INT                                          IDE_COL IDE_CP
#>       <char>                                           <char>  <int>
#>   1:                             PRADOS DE SANTA ROSA Colonia  66610
#>   2:                             PRADOS DE SANTA ROSA Colonia  66610
#>   3:          VALLE DE SANTA LUCIA (GRANJA SANITARIA) Colonia  64140
#>   4:                                       COSMÓPOLIS Colonia  66612
#>   5:                                 MUJERES ILUSTRES Colonia  66635
#>  ---                                                                
#> 195:         EL MIRADOR DE SAN NICOLÁS (FOMERREY 129) Colonia  66422
#> 196:                              CIUDAD GENERAL TERÁN Pueblo  67400
#> 197:                                         MATAMOROS Barrio  67510
#> 198:                                         VICTORIA Colonia  64520
#> 199:                                          EL DÓLAR Barrio  65200
#>      CVE_LOC_RES              DES_LOC_RES CVE_MPO_RES              DES_MPO_RES
#>            <int>                   <char>       <int>                   <char>
#>   1:         379     PRADOS DE SANTA ROSA           6                  APODACA
#>   2:         379     PRADOS DE SANTA ROSA           6                  APODACA
#>   3:           1                MONTERREY          39       MONTERREY NVO LEON
#>   4:           1           CIUDAD APODACA           6                  APODACA
#>   5:           1           CIUDAD APODACA           6                  APODACA
#>  ---                                                                          
#> 195:           1 SAN NICOLÁS DE LOS GARZA          46 SAN NICOLAS DE LOS GARZA
#> 196:         232                 SAN JOSÉ          22            GENERAL TERAN
#> 197:           1             MONTEMORELOS          38             MONTEMORELOS
#> 198:           1                MONTERREY          39       MONTERREY NVO LEON
#> 199:           1   CIUDAD SABINAS HIDALGO          44          SABINAS HIDALGO
#>          DES_JUR_RES CVE_EDO_RES DES_EDO_RES CVE_LOC_REP
#>               <char>       <int>      <char>       <int>
#>   1:       GUADALUPE          19  NUEVO LEON         379
#>   2:       GUADALUPE          19  NUEVO LEON         379
#>   3:       MONTERREY          19  NUEVO LEON           1
#>   4:       GUADALUPE          19  NUEVO LEON           1
#>   5:       GUADALUPE          19  NUEVO LEON           1
#>  ---                                                    
#> 195:         HIDALGO          19  NUEVO LEON           1
#> 196:    MONTEMORELOS          19  NUEVO LEON         232
#> 197:    MONTEMORELOS          19  NUEVO LEON           1
#> 198:         HIDALGO          19  NUEVO LEON           1
#> 199: SABINAS HIDALGO          19  NUEVO LEON           1
#>                   DES_LOC_REP CVE_MPO_REP              DES_MPO_REP
#>                        <char>       <int>                   <char>
#>   1:     PRADOS DE SANTA ROSA           6                  APODACA
#>   2:     PRADOS DE SANTA ROSA           6                  APODACA
#>   3:                MONTERREY          39       MONTERREY NVO LEON
#>   4:           CIUDAD APODACA           6                  APODACA
#>   5:           CIUDAD APODACA           6                  APODACA
#>  ---                                                              
#> 195: SAN NICOLÁS DE LOS GARZA          46 SAN NICOLAS DE LOS GARZA
#> 196:                 SAN JOSÉ          22            GENERAL TERAN
#> 197:             MONTEMORELOS          38             MONTEMORELOS
#> 198:                MONTERREY          39       MONTERREY NVO LEON
#> 199:   CIUDAD SABINAS HIDALGO          44          SABINAS HIDALGO
#>          DES_JUR_REP CVE_EDO_REP DES_EDO_REP ESTATUS_CASO CVE_DIAG_PROBABLE
#>               <char>       <int>      <char>        <int>             <int>
#>   1:       GUADALUPE          19  NUEVO LEON            1                 1
#>   2:       GUADALUPE          19  NUEVO LEON            1                 1
#>   3:       MONTERREY          19  NUEVO LEON            1                 1
#>   4:       GUADALUPE          19  NUEVO LEON            1                 1
#>   5:       GUADALUPE          19  NUEVO LEON            1                 1
#>  ---                                                                       
#> 195:         HIDALGO          19  NUEVO LEON            1                 2
#> 196:    MONTEMORELOS          19  NUEVO LEON            1                 1
#> 197:    MONTEMORELOS          19  NUEVO LEON            1                 1
#> 198:         HIDALGO          19  NUEVO LEON            1                 1
#> 199: SABINAS HIDALGO          19  NUEVO LEON            1                 1
#>                DES_DIAG_PROBABLE DES_DIAG_FINAL FEC_INI_SIGNOS_SINT   ANO   SEM
#>                           <char>         <char>              <IDat> <int> <int>
#>   1:             DENGUE NO GRAVE                         2025-05-10  2025    19
#>   2:             DENGUE NO GRAVE                         2025-05-19  2025    21
#>   3:             DENGUE NO GRAVE                         2025-05-17  2025    20
#>   4:             DENGUE NO GRAVE                         2025-01-02  2025     1
#>   5:             DENGUE NO GRAVE                         2025-01-01  2025     1
#>  ---                                                                           
#> 195: DENGUE CON SIGNOS DE ALARMA                         2025-06-08  2025    24
#> 196:             DENGUE NO GRAVE                         2025-06-13  2025    24
#> 197:             DENGUE NO GRAVE                         2025-06-13  2025    24
#> 198:             DENGUE NO GRAVE                         2025-06-15  2025    25
#> 199:             DENGUE NO GRAVE                         2025-06-11  2025    24
#>      MANEJO DES_INS_UNIDAD DENGUE_SER_TRIPLEX FEC_INGRESO
#>       <int>         <char>              <int>      <IDat>
#>   1:      2            SSA                 NA        <NA>
#>   2:      2            SSA                 NA        <NA>
#>   3:      2            SSA                 NA        <NA>
#>   4:      2           IMSS                 NA        <NA>
#>   5:      2           IMSS                 NA        <NA>
#>  ---                                                     
#> 195:      1            SSA                 NA  2025-06-16
#> 196:      2            SSA                 NA        <NA>
#> 197:      2        PRIVADO                 NA        <NA>
#> 198:      2           IMSS                 NA        <NA>
#> 199:      2            SSA                 NA        <NA>