Read the dengue dataset of [SINAVE](https://www.sinave.gob.mx/)

read_dengue_dataset(
  path,
  spatial_resolution,
  status_caso,
  des_edo_res = NULL,
  des_mpo_res = NULL
)

Arguments

path

is the path of dengue dataset.

spatial_resolution

is the spatial resolution or the administrative level. The values are country, state and municipality.

status_caso

1 probable, 2 confirmado, & 3 descartado.

des_edo_res

is a string for define the state in uppercase.

des_mpo_res

is a string for define the municipality in uppercase.

Value

a data.table object.

Author

Felipe Antonio Dzul Manzanilla felipe.dzul.m@gmail.com

Examples

read_dengue_dataset(path = "/Users/fdzul/Library/CloudStorage/Dropbox/dataset/dge/denv/2025/DENGUE2_.txt", spatial_resolution = "state", des_edo_res = "NUEVO LEON", status_caso = c(1, 2))
#>               FOL_ID  VEC_ID IDE_EDA_ANO IDE_SEX DES_CAL
#>               <char>   <int>       <int>   <int>  <char>
#>   1: 19039SAMM010109 1927443          24       2   CALLE
#>   2: 19039CURP000727 1927123          24       2   CALLE
#>   3: 28019MAAM600505 1929417          64       2   CALLE
#>   4: 19038EEAE050622 1928778          19       2   CALLE
#>   5: 24028AARJ881221 1928971          36       1   CALLE
#>  ---                                                    
#> 521: 19039RAGF770822 1919248          47       1   CALLE
#> 522: 19026RISY970701 1919145          27       2   CALLE
#> 523: 19039HEML881119 1921051          36       2   CALLE
#> 524: 19039MAMM040416 1921224          20       2   CALLE
#> 525: 19033CAPA011101 1922124          23       2   CALLE
#>                        IDE_CAL NUM_EXT NUM_INT
#>                         <char>  <char>  <char>
#>   1:         HIPOLITO IRIGOYEN     371        
#>   2:             LOS RODRIGUEZ    6433        
#>   3:                   BOLIVIA     206        
#>   4:                 MEMBRILLO     228        
#>   5:                   NARANJO     232        
#>  ---                                          
#> 521:                   BEGONIA     647        
#> 522:                     COLON     415        
#> 523:      RICARDO FLORES MAGON    1976        
#> 524:  SEGUNDA DE SAN FRANCISCO    1312        
#> 525: CARLOS SALINAS DE GORTARI      SN        
#>                                    IDE_COL IDE_CP CVE_LOC_RES
#>                                     <char>  <int>       <int>
#>   1:                    SAN MARTÍN Colonia  64210           1
#>   2:                 RAFAEL BUELNA Colonia  64240           1
#>   3:  LOS ÁNGELES SECTOR 7 Fraccionamiento  66475           1
#>   4: HACIENDA LOS NARANJOS Fraccionamiento  67528           1
#>   5:                  UNIÓN MODELO Colonia  67165           1
#>  ---                                                         
#> 521:            LAS FLORES Fraccionamiento  66064           1
#> 522:                   DEL MAESTRO Colonia  67140           1
#> 523:        JOSE MARIA PINO SUÁREZ Colonia  64103           1
#> 524:                         CANTÚ Colonia  64550           1
#> 525:                       CAMACHO Colonia  67730           1
#>                   DES_LOC_RES CVE_MPO_RES              DES_MPO_RES  DES_JUR_RES
#>                        <char>       <int>                   <char>       <char>
#>   1:                MONTERREY          39       MONTERREY NVO LEON    MONTERREY
#>   2:                MONTERREY          39       MONTERREY NVO LEON    MONTERREY
#>   3: SAN NICOLÁS DE LOS GARZA          46 SAN NICOLAS DE LOS GARZA      HIDALGO
#>   4:             MONTEMORELOS          38             MONTEMORELOS MONTEMORELOS
#>   5:                GUADALUPE          26      GUADALUPE  NVO LEON    GUADALUPE
#>  ---                                                                           
#> 521:  CIUDAD GENERAL ESCOBEDO          21         GENERAL ESCOBEDO      HIDALGO
#> 522:                GUADALUPE          26      GUADALUPE  NVO LEON    GUADALUPE
#> 523:                MONTERREY          39       MONTERREY NVO LEON    MONTERREY
#> 524:                MONTERREY          39       MONTERREY NVO LEON      HIDALGO
#> 525:                  LINARES          33                  LINARES MONTEMORELOS
#>      CVE_EDO_RES DES_EDO_RES CVE_LOC_REP              DES_LOC_REP CVE_MPO_REP
#>            <int>      <char>       <int>                   <char>       <int>
#>   1:          19  NUEVO LEON           1                MONTERREY          39
#>   2:          19  NUEVO LEON           1                MONTERREY          39
#>   3:          19  NUEVO LEON           1 SAN NICOLÁS DE LOS GARZA          46
#>   4:          19  NUEVO LEON           1             MONTEMORELOS          38
#>   5:          19  NUEVO LEON           1                GUADALUPE          26
#>  ---                                                                         
#> 521:          19  NUEVO LEON           1  CIUDAD GENERAL ESCOBEDO          21
#> 522:          19  NUEVO LEON           1                GUADALUPE          26
#> 523:          19  NUEVO LEON           1                MONTERREY          39
#> 524:          19  NUEVO LEON           1                MONTERREY          39
#> 525:          19  NUEVO LEON           1                  LINARES          33
#>                   DES_MPO_REP  DES_JUR_REP CVE_EDO_REP DES_EDO_REP ESTATUS_CASO
#>                        <char>       <char>       <int>      <char>        <int>
#>   1:       MONTERREY NVO LEON    MONTERREY          19  NUEVO LEON            1
#>   2:       MONTERREY NVO LEON    MONTERREY          19  NUEVO LEON            2
#>   3: SAN NICOLAS DE LOS GARZA      HIDALGO          19  NUEVO LEON            1
#>   4:             MONTEMORELOS MONTEMORELOS          19  NUEVO LEON            1
#>   5:      GUADALUPE  NVO LEON    GUADALUPE          19  NUEVO LEON            1
#>  ---                                                                           
#> 521:         GENERAL ESCOBEDO      HIDALGO          19  NUEVO LEON            1
#> 522:      GUADALUPE  NVO LEON    GUADALUPE          19  NUEVO LEON            1
#> 523:       MONTERREY NVO LEON    MONTERREY          19  NUEVO LEON            1
#> 524:       MONTERREY NVO LEON      HIDALGO          19  NUEVO LEON            1
#> 525:                  LINARES MONTEMORELOS          19  NUEVO LEON            1
#>      CVE_DIAG_PROBABLE           DES_DIAG_PROBABLE              DES_DIAG_FINAL
#>                  <int>                      <char>                      <char>
#>   1:                 1             DENGUE NO GRAVE                            
#>   2:                 2 DENGUE CON SIGNOS DE ALARMA DENGUE CON SIGNOS DE ALARMA
#>   3:                 1             DENGUE NO GRAVE                            
#>   4:                 1             DENGUE NO GRAVE                            
#>   5:                 1             DENGUE NO GRAVE                            
#>  ---                                                                          
#> 521:                 1             DENGUE NO GRAVE                            
#> 522:                 1             DENGUE NO GRAVE                            
#> 523:                 1             DENGUE NO GRAVE                            
#> 524:                 1             DENGUE NO GRAVE                            
#> 525:                 1             DENGUE NO GRAVE                            
#>      FEC_INI_SIGNOS_SINT   ANO   SEM MANEJO DES_INS_UNIDAD DENGUE_SER_TRIPLEX
#>                   <IDat> <int> <int>  <int>         <char>              <int>
#>   1:          2025-02-04  2025     6      2           IMSS                 NA
#>   2:          2025-01-25  2025     4      2            SSA                  0
#>   3:          2025-01-30  2025     5      1           IMSS                 NA
#>   4:          2025-02-06  2025     6      1           IMSS                 NA
#>   5:          2025-02-04  2025     6      2            SSA                 NA
#>  ---                                                                         
#> 521:          2025-01-03  2025     1      2           IMSS                 NA
#> 522:          2025-01-05  2025     2      2           IMSS                 NA
#> 523:          2025-01-09  2025     2      2           IMSS                 NA
#> 524:          2025-01-14  2025     3      2           IMSS                 NA
#> 525:          2025-01-18  2025     3      2            SSA                 NA
#>      FEC_INGRESO
#>           <IDat>
#>   1:        <NA>
#>   2:        <NA>
#>   3:  2025-02-07
#>   4:  2025-02-07
#>   5:        <NA>
#>  ---            
#> 521:        <NA>
#> 522:        <NA>
#> 523:        <NA>
#> 524:        <NA>
#> 525:        <NA>